Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHATP28329 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHATP28329 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHATP28329 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHATP28329 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHATP28329 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHATP28329 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHATP28329 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms