Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HRCP23327 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HRCP23327 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HRCP23327 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HRCP23327 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HRCP23327 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HRCP23327 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HRCP23327 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HRCP23327 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms