Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms