Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM2O43147 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms