Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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