Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC160A6NGH7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC160A6NGH7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms