Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX11Q9Y6N1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX11Q9Y6N1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX11Q9Y6N1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms