Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H9

PCDHA2, Protocadherin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA2Q9Y5H9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA2Q9Y5H9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA2Q9Y5H9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA2Q9Y5H9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms