Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFG3L2Q9Y4W6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFG3L2Q9Y4W6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFG3L2Q9Y4W6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms