Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN3Q9Y4C0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN3Q9Y4C0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NRXN3Q9Y4C0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NRXN3Q9Y4C0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms