Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRKBQ9Y3C4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRKBQ9Y3C4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms