Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED7Q9Y3B3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED7Q9Y3B3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED7Q9Y3B3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED7Q9Y3B3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms