Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFR3BQ9Y2G0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFR3BQ9Y2G0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms