Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFSF13BQ9Y275 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFSF13BQ9Y275 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFSF13BQ9Y275 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFSF13BQ9Y275 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFSF13BQ9Y275 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFSF13BQ9Y275 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms