Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC3Q9UQE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMC3Q9UQE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1287 ms