Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PHF8Q9UPP1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHF8Q9UPP1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PHF8Q9UPP1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PHF8Q9UPP1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms