Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NRXN1Q9ULB1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NRXN1Q9ULB1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NRXN1Q9ULB1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms