Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PNMA3Q9UL41 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA3Q9UL41 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA3Q9UL41 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms