Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP8AP2Q9UKL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP8AP2Q9UKL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP8AP2Q9UKL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms