Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRTO4Q9UKD2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRTO4Q9UKD2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms