Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCP2D1Q9UJQ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms