Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIX4Q9UIU6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIX4Q9UIU6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIX4Q9UIU6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms