Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEFF2Q9UIK5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEFF2Q9UIK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms