Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUF60Q9UHX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms