Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMGXB4Q9UGU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGXB4Q9UGU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGXB4Q9UGU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms