Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5BQ9UGL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5BQ9UGL1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
KDM5BQ9UGL1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5BQ9UGL1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms