Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXF1Q9UBU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF1Q9UBU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NXF1Q9UBU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms