Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK2Q9UBU2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK2Q9UBU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms