Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK4Q9UBT3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK4Q9UBT3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK4Q9UBT3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms