Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK7

RABL2A, Rab-like protein 2A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL2AQ9UBK7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RABL2AQ9UBK7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABL2AQ9UBK7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms