Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNFX1Q9P2E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNFX1Q9P2E3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms