Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD2L1Q9P0L9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2L1Q9P0L9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms