Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYOFQ9NZM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYOFQ9NZM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms