Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD1Q9NXG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms