Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM260Q9NX78 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM260Q9NX78 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM260Q9NX78 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM260Q9NX78 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM260Q9NX78 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms