Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAK1IP1Q9NWT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAK1IP1Q9NWT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms