Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKDREJQ9NTG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDREJQ9NTG1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms