Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRMQ9NS64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRMQ9NS64 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRMQ9NS64 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRMQ9NS64 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms