Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INCENPQ9NQS7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INCENPQ9NQS7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INCENPQ9NQS7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms