Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINT3Q9NQE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HINT3Q9NQE9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms