Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE2Q9NQ36 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE2Q9NQ36 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms