Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP3Q9NQ35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms