Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH12Q9NPG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH12Q9NPG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH12Q9NPG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH12Q9NPG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH12Q9NPG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms