Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP25Q9NPA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP25Q9NPA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms