Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KCNMB3Q9NPA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNMB3Q9NPA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNMB3Q9NPA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms