Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCB9Q9NP78 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCB9Q9NP78 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCB9Q9NP78 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms