Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CENPJQ9HC77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CENPJQ9HC77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CENPJQ9HC77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPJQ9HC77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms