Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK4Q9HAZ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK4Q9HAZ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK4Q9HAZ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms