Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD3Q9H7B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD3Q9H7B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD3Q9H7B4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD3Q9H7B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD3Q9H7B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD3Q9H7B4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD3Q9H7B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMYD3Q9H7B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD3Q9H7B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD3Q9H7B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms