Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF4Q9H2L5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF4Q9H2L5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms